抗體測序服務
單克隆抗體分子在藥物研發(fā)、診斷試劑開發(fā)中扮演了關鍵的角色??贵w分子的一級結(jié)構(gòu),特別是其CDR區(qū)域的氨基酸序列是發(fā)揮其生物學功能的核心,對其完整序列準確快速的分析具有十分重要的意義??返律锊捎米钕冗M的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀和強大的抗體測序數(shù)據(jù)處理軟件PEAKS AB Software,結(jié)合基因測序和生物信息學數(shù)據(jù)庫,建立了全新一代抗體測序平臺,實現(xiàn)對抗體一級結(jié)構(gòu)快速準確的分析從而保證每一個抗體測序的準確性。我們的平臺適用于不同亞型抗體,如IgA,IgE,IgG和IgM,以及不同形式的抗體,如熒光偶聯(lián)抗體,固定化抗體,不同物種的抗體的序列分析。
項目特征:
*僅需200ug抗體即可設計與完成LC-MS/MS 分析
*基于蛋白數(shù)據(jù)庫的de novo蛋白測序技術
*適用于所有物種抗體和不同抗體亞型
*直接定量轉(zhuǎn)錄后修飾和變異序列
*14天內(nèi)出結(jié)果(包含節(jié)假日)
服務優(yōu)勢:
---抗體測序服務保證100%準確
seline;">我們的測序服務執(zhí)行嚴格的質(zhì)量控制,采用寬進窄出的原則,在不遺漏任何有效數(shù)據(jù)信息的同時實現(xiàn)了抗體序列的準確鑒定。目前我們實驗室使用的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀,相比于上一代Orbitrap Elite質(zhì)譜儀,Lumos在提高了一級二級質(zhì)譜掃描速度的同時保證肽段分子量的準確性。同時結(jié)合我們行業(yè)標桿性邏輯算法和強大的處理能力(基于PEAKS軟件分析),我們的抗體測序平臺將傳統(tǒng)技術很難區(qū)分分子量接近的氨基酸變得更加容易和精確,如實現(xiàn)分子量差異在0.03Da的谷氨酰胺和賴氨酸差別分析。
---抗體測序服務保證100%序列覆蓋
卡梅德生物針對不同的項目需求,會采用多達8種不同的蛋白酶對目標抗體進行消化酶切,利用PEAKS軟件自動實現(xiàn)不同輕重鏈酶切肽段之間100%全序列拼接。對于抗體互補決定區(qū)域(CDR區(qū)域),至少生成含有單個位點的肽段序列10次,通過高覆蓋率,以保證后續(xù)抗體序列拼接準確。
---強大的修飾分析能力
我們的抗體測序平臺能夠高效地區(qū)分同源氨基酸的不同變異體,通過二級碎裂片段的特征峰即可實現(xiàn)亮氨酸和異亮氨酸的準確判定。對于轉(zhuǎn)錄后修飾的氨基酸分子,我們的系統(tǒng)也能高效區(qū)分。
---適用于熒光標記單抗、IgMs、及其他非傳統(tǒng)抗體進行測序
我們的抗體測序技術同樣能夠高效地完成小基團,如FITC、Biotin、Alexa等標記抗體的測序工作,在增加抗體樣品量的情況下,我們也能完成類似GST等大蛋白基團標記的抗體測序工作。我們的技術適用于任何類型的抗體測序工作,目前我們已經(jīng)成功測序來自小鼠,兔子,羊駝,倉鼠和羊的抗體。在實際操作中,IGM的測序方法類似IgG,只是前者需要更多的蛋白樣品。
---嚴謹?shù)男蛄蓄A測和嚴格的序列驗證
對于每一個抗體測序項目,我們都會給出具體的實驗方案。首先,我們會先對項目抗體進行序列預測。如客戶直接提供雜交瘤,我們也可以先進行抗體測序后,再結(jié)合mRNA測序信息,以確??贵w單個氨基酸測序的準確性。同時,我們還會建立以測定序列為基礎的數(shù)據(jù)庫,采用序列確認的模式對采集到的質(zhì)譜數(shù)據(jù)進行二次比對分析,以確保交付的產(chǎn)品完全無誤。