發(fā)布日期:2017-08-30
麻省理工學院的計算機科學和人工智能實驗室采用包括電子健康數(shù)據(jù)記錄等多種類型的醫(yī)療數(shù)據(jù)以預測醫(yī)療情況。兩個團隊分別創(chuàng)建了“ICU 干預”和“EHR 模型遷移”機器學習方法,致力于改進患者護理條件。 醫(yī)生經(jīng)常因需要察看各種圖表、測驗結果和其他指標所困擾。想要在整合與監(jiān)測多個患者數(shù)據(jù)的同時做出實時治療決策是十分困難的,特別是當醫(yī)院之間數(shù)據(jù)記錄不一致時,其所造成的挑戰(zhàn)就更大了。 麻省理工學院的計算機科學和人工智能實驗室(CSAIL)的研究人員在一則新的文章中探討了怎樣能利用電腦幫助醫(yī)生做出更好醫(yī)療決策。 其中,一個團隊創(chuàng)建了一種名為“重癥監(jiān)護室干預(ICU Intervene)”的機器學習方法,該方法需要大量的重癥監(jiān)護室(ICU)數(shù)據(jù),所需數(shù)據(jù)包括人的生命特征、實驗室數(shù)據(jù)、說明筆記、人口統(tǒng)計數(shù)據(jù),以確定不同癥狀需要何種治療方法。該系統(tǒng)使用“深度學習”技術進行實時預測,從過去的 ICU 案例中學習,從而為重癥監(jiān)護提出建議,同時解釋做出這些決策的原因。 有關 ICU 干預文章的主要作者 Harini Suresh 博士說:“該系統(tǒng)可能有助于在 ICU 中時刻待命的醫(yī)生,因為這是一個有著高壓力、高需求的環(huán)境。其目標是利用醫(yī)療記錄中的數(shù)據(jù)來改善醫(yī)療條件并對可能出現(xiàn)的干預情況做出預測。” 另一個團隊則開發(fā)出了“EHR 模型遷移”的方法,其對于處理來自不同 EHR 系統(tǒng)的數(shù)據(jù)能夠進行系統(tǒng)訓練,可以用于幫助應用預測模型于電子健康記錄(EHR)系統(tǒng)。具體來說,使用該研究團隊的這種方法,可以實現(xiàn)在一個 EHR 系統(tǒng)上訓練得出死亡率數(shù)據(jù)和延長停留時間的預測模型,并將得出的模型遷移在另一個 EHR 系統(tǒng)中進行預測。 ICU 干預由 Suresh 博士、Nathan Hunt、Alistair Johnson 博士后、Leo Anthony Celi 研究員、麻省理工學院教授 Peter Szolovits 和博士生 Marzyeh Ghassemi 共同開發(fā),并于本月在波士頓醫(yī)療機器學習會議上首次提出。 EHR 模型轉(zhuǎn)移由 CSAIL 在讀博士生 Jen Gong 和 Tristan Naumann,以及 Szolovits 和電氣工程教授 John Guttag 共同研發(fā)。其在加拿大哈利法克斯的 ACM 知識發(fā)現(xiàn)和數(shù)據(jù)挖掘特別興趣小組上首次提出。 上述兩模型都使用了來自關鍵護理數(shù)據(jù)庫 MIMIC 的數(shù)據(jù)進行了培訓,其中的數(shù)據(jù)包括來自大約 40000 名重癥監(jiān)護病人的去標識數(shù)據(jù),并由麻省理工學院計算生理學實驗室開發(fā)。 重癥監(jiān)護室(ICU)干預 整合 ICU 數(shù)據(jù)對于預測患者健康結果過程的自動化而言至關重要。 Suresh 表示:“此前,臨床決策中的許多工作都關注于死亡率等結果上,而這項工作的出現(xiàn)則是預測可行的治療方法。此外,該系統(tǒng)能夠使用單一模型預測出多種結果。” ICU 干預專注于對五種關鍵措施以小時為單位進行預測,措施涵蓋各種關鍵護理需求,如呼吸輔助、改善心血管功能、降低血壓、輸液治療。 每小時,系統(tǒng)從代表生命體征的數(shù)據(jù)以及臨床筆記和其他數(shù)據(jù)點中提取值。所有數(shù)據(jù)都用值表示,表示患者距平均值多遠(然后評估進一步治療)。 重要的是,ICU 干預可以對未來做出預測。例如,該模型可以預測 6 小時后患者是否需要呼吸機,而不僅僅只能預測出患者在 30 分鐘或 1 小時后需要使用呼吸機。該團隊還專注于為模型的預測提供推理,為醫(yī)生提供更多的見解。 斯坦福大學醫(yī)學副教授奈加姆·沙阿(Nigam Shah)說,“基于神經(jīng)網(wǎng)絡的深層神經(jīng)預測模型往往因其機器的身份而受到批評,然而,這些作者高度準確地預測了醫(yī)療干預的開始和結束,并且能夠?qū)嶋H證實其做出的預測的可解釋性。” 該團隊發(fā)現(xiàn),該系統(tǒng)在預測干預措施方面優(yōu)于從前,并且特別擅長預測血管加壓素的需要,這是一種用于收緊血管并提高血壓的藥物。 將來,研究人員將努力改進 ICU 干預,以便能夠為患者提供更多個性化護理,并為決策提供更先進的預測,例如為什么一個患者有可能逐漸減少類固醇,又或是為什么另一個患者可能需要進行內(nèi)鏡檢查。 EHR 模型遷移 利用 ICU 數(shù)據(jù)的另一個重要考慮因素是其存儲方式以及當存儲方法發(fā)生變化時可能出現(xiàn)的情況?,F(xiàn)有的機器學習模型需要以一致的方式編碼數(shù)據(jù),因此醫(yī)院經(jīng)常改變其 EHR 系統(tǒng)就可能會為數(shù)據(jù)分析和預測帶來重大問題。 這就是 EHR 模型遷移的用武之地。該方法適用于不同版本的 EHR 平臺,使用自然語言處理來識別跨系統(tǒng)編碼的臨床信息,然后將其映射到常見的臨床信息中(如“血壓”和“心率”)。 例如,一個 EHR 平臺中的病人可能正在轉(zhuǎn)換醫(yī)院,并需要將其數(shù)據(jù)傳輸?shù)讲煌愋偷钠脚_。EHR 模型遷移旨在確保該模型能夠保持對患者情況的預測能力,例如患者長期停留,或是出現(xiàn)死亡的可能性。 Shah 說:“用于醫(yī)療治療的機器學習模型往往有著系統(tǒng)外部效度低下、站點之間的便攜性差的缺點。而這些作者卻設計了一個精妙的策略,即在醫(yī)學本體中使用已掌握的知識,從而在兩個網(wǎng)站之間得出共同承認的表達,其能夠幫助模型在一網(wǎng)站上經(jīng)過訓練后能在另一個網(wǎng)站上表現(xiàn)良好。能夠看到這樣創(chuàng)造性地使用編碼醫(yī)學知識來增強預測模型的可移植性,我很興奮。“ 利用 EHR 模型遷移,該團隊測試了其模型對兩種結果的預測能力:死亡率和長期住院需求。他們在一個 EHR 平臺上對模型進行了訓練,然后在不同的平臺對其預測進行了測試。發(fā)現(xiàn) EHR 模型遷移優(yōu)于普通方法,并且與單獨使用 EHR 特異性事件相比,EHR 預測模型能夠更好地進行數(shù)據(jù)遷移。 未來,EHR 模型遷移小組計劃對其他醫(yī)院和護理機構的數(shù)據(jù)和 EHR 系統(tǒng)進行評估。 本文來自于 MIT News,由億歐編譯,編譯作者曾朵。
來源:億歐